「直腸及肛門瘺管」的病因大多是「肛門腺體」(Anal glands)受感染後灌膿，流膿之後難以愈合，令肛門周邊及近臀部位置出現慢性感染，最後形成瘺管。瘺管引致肛門不適，長期流膿引致令人困擾的衛生問題，甚至「敗血症」(Septicaemia)，即細菌入血。
「直腸及肛門瘺管」或與「克隆氏症」(Crohn's disease) 有關，「磁共振掃描」(Magnetic resonance imaging) 有助評估病情。
手術治療可根除瘺管，但須小心避免損壞「括約肌」，否則可能引致大便失禁。
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